Hi-Di™ ფორმამიდი

კატალოგის ნომერი: A30011

Ion 540™ Chef-ნაკრები საშუალებას იძლევა სექვენირებისთვის საჭირო ნიმუში მომზადდეს ავტომატიზებულ რეჟიმში. ნაკრები გათვლილია 200 აზოტოვანი ფუძის სიგრძის ფრაგმენტების ბიბლიოთეკის მოსამზადებლად, რომელთა სექვენირება მომდევნო ეტაპზე ხორციელდება Ion S5™ ან Ion S5™ XL სექვენირების პლატფორმებზე. Ion 540 ნაკრები მოიცავს წინასწარ დაკომპლექტებულ რეაგენტების კარტრიჯს,  რომელსაც ინტეგრირებული აქვს ნიმუშის კონტროლის, მიწოდების და ავტომატური პროტოკოლის მართვის ფუნქციები. ნაკრებით შესაძლებელია ჩიპებზე დატანილი 8 ნიმუშის სექვენირება. ნაკრები შეიცავს საკმარის რეაგენტებს 4 ინიციალიზაციისა და 8 სექვენირების რეაქციისთვის Ion S5 ან Ion S5 XL სისტემებზე.   Ion 540 ნაკრები Ion Chef და Ion S5/Ion S5 XL სისტემებისთვის:

• უზრუნველყოფს მატრიცების მომზადებას და ჩიპის ჩატვირთვას, ბიბლიოთეკის რიდების სიგრძე 200 აზოტოვანი ფუძე;
• ამარტივებს კვლევას გამოყენებისთვის მზა, ერთჯერადი რეაგენტების კარტრიჯებით;
• სწრაფი და მარტივი პროტოკოლი, 15 წუთზე ნაკლები დრო რეაქციის მოსამზადებლად;
• მიღებული აკურატული მონაცემები აუმჯობესებს შედეგების ანალიზის და ინტერპრეტაციის შესაძლებლობებს.

კატალოგის ნომერი: A31136 Ion AmpliSeq™ Direct FFPE - დნმ ნაკრებით შესაძლებელია დნმ-ნიმუშების მომზადება ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან. აღნიშნული ნიმუშები გამოიყენება ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის Ion AmpliSeq პროტოკოლის გამოყენებით. აღსანიშნავია, რომ დნმ-ის მისაღებად ქსოვილური ნიმუშების დეპარაფინიზაცია ამ შემთხვევაში საჭირო არ არის. კიტი თავსებადია FFPE ნიმუშებთან, რომელთა დაჭრა ხდება 10 µm სისქის ანათლებად. Ion AmpliSeq Direct FFPE -დნმ ნაკრების მახასიათებლებს შორის აღსანიშნავია:

• მარტივი პროტოკოლი, რომელიც ნიმუშის დაკარგვის პრობლემას გამორიცხავს;
• ეფექტური 30-წუთიანი პროტოკოლი, მხოლოდ 10 წუთის ხანგრძლივობის ხელით სამუშაო დროით;
• იდეალურია FFPE დნმ-ნიმუშებდან დნმ-ის გამოსაყოფად, როდესაც ნიმუში ლიმიტირებული რაოდენობითაა;
• FFPE ანათლების დეპარაფინიზაცია არ არის საჭირო;
• სპინ- ან ბიდ-დამოკიდებული დნმ-ის ექსტრაქცია არ არის საჭირო;
• Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მომზადება ხდება მხოლოდ 1 ng დნმ-ნიმუშიდან;
• პროტოკოლი მოიცავს ნიმუშების ურაცილ-D-გლიკოზილაზათი დამუშავებას, რაც დეამინირებული ციტოზინის არიდან ელიმინაციის შესაძლებლობას ქმნის.

კატალოგის ნომერი: AM12350 RNase- და DNase-თავისუფალი მიკროცენტრიფუგის ტუბები არამწერბარე (low-binding) კედლების ზედაპირით განკუთვლინია დნმ/რნმ ნიმუშებისთვის. სინჯარები გრადუირებული კედლით მდგრადია ტემპერატურის ფართო დიაპაზონზე -90°C-დან +120°C-მდე.  

კატალოგის ნომერი: 4475346 Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან ("hot spot" მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™  სიმსივნური "Hotspot"-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:

• თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
• მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
• პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
• გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.

სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური "Hotspot"-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში. ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0 ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.