წყალი ნუკლეაზების გარეშე (DEPC-დაუმუშავებელი)

კატალოგის ნომერი: A25597 MagMAX™ DNA - სხვადასხვა ტიპის ნიმუშდან დნმ-ის გამოყოფისთვის ოპტიმიზებული ტექნოლოგიით. ნაკრებით ხორციელდება გენომური დნმ-ის (gDNA) ექსტრაქცია ისეთი ტიპის ნიმუშებიდან, როგორიცაა სისხლი, ეპითელური უჯრედები, ნერწყვი, შარდი, სისხლის ნიმუშის ფირფიტები, პირის ღრუს სითხეები და ქსოვილები. მაგნიტურ ბიდებზე დაფუძნებული ექსტრაქციის სისტემა შესაძლებელს ხდის დღის განმავლობაში გაკეთდეს ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქცია 12-დან 500-მდე ნიმუშიდან. ექსტრაქციის ნაკრები იდეალურია ფარმაკოგენომიკური კვლევებისთვის (PGx).  MagMAX™ DNA Multi-Sample Ultra - ნაკრები ხასიათდება:

• მარტივი პროტოკოლი დნმ-ის ექსტრაქციისთვის სხვადასხვა ტიპის ბიოლოგიური ნიმუშებიდან;
• ოპტიმიზებული დნმ-ის მაღალი წარმადობით ექსტრაქციისთვის, თავსებადი OpenArray® და Ion AmpliSeq™ აპლიკაციებთან;

​MagMAX™ მაგნიტური ბიდებით ექსტრაქციის ნაკრების უპირატესობები მაგნიტური ბიდების ტექნოლოგია გვთავაზობს მნიშვნელოვან უპირატესობას გენომური დნმ-ის გამოყოფის სხვა ტექნოლოგიებთან შედარებით. ბიდები იკავშირებს gDNA-ს უფრო ეფექტურად ვიდრე ფილტრები, რაც მაღალი წარმადობის გარანტიას იძლევა.

კატალოგის ნომერი: 4471250 Ion Xpress™ ბარკოდების ადაპტერების 1-16 ნაკრები მოიცავს 16 უნიკალურ ბარკოდის ადაპტერს, რომლებიც სპეციფიკურად შექმნილია და ვალიდირებულია Torrent PGM™ და Proton™ სექვენატორებზე რეაქციების ოპტიმალური შესრულებისთვის. როდესაც ნაკრები Ion Xpress™ Plus ან Ion Plus Fragment - ბიბლიოთეკის ფრაგმენტების მოსამზადებელ ნაკრებებთან კომპლექტში გამოიყენება, იგი მომხმარებელს   საშუალებას აძლევს მოახდინოს ფრაგმენტთა 16-მდე ნაკრების მულტიპლექსირება ემულსიური პჯრ-ს ეტაპზე და შემდგომ მულტიპლექსური სექვენირება. ამ კიტის გამოყენება შესაძლებელია სხვა ბარკოდების ადაპტერების ნაკრებთან ერთად, რაც საბოლოო ჯამში ბიბლიოთეკის 96 ფრაგმენტის (96 სხვადახვა ნიმუშის) მულტიპლექსური სექვენირების შესაძლებლობას ქმნის. მოლეკულური ბარკოდების გამოყენება საშუალებას იძლევა განხორციელდეს სხვადასხვა დნმ-ფრაგმენტების მულტიპლექსირება სექვენირების ერთ ჩიპზე, რაც მაღალი წარმადობის და ეფექტურობის გარანტიაა.  

კატალოგის ნომერი:  A35806 Oncomine-ის ნაკრები v3 სრულყოფილი ანალიზისთვის, არის შემდეგი თაობის სექვენირების რეაგენტთა ნაკრები, რომელიც ახდენს SNV, CNV, გენთა შერწყმის, ინსერცია-დელეციების დეტექციას 161 უნიკალური გენიდან, რაც მეცნიერებს ეხმარება განახორციელონ პრეპარატების შესწავლა და სხვა კლინიკური კვლევითი პროგრამები. რეაგენტების ნაკრებში ბიბლიოთეკის მოსამზადებლად, გაერთიანიებულია პრაიმერების 4 კომპლექტი, დნმ-ის და რნმ-ის მატრიცების მულტიპლექსირებისთვის. მათი საშუალებით სექვენირების ბიბლიოთეკის მომზადება ხორციელდება ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) სიმსივნური ქსოვილებიდან. ნაკრები ოპტიმიზებულია სექვენირებისთვის Ion S5 სისტემაზე, Ion 540 ჩიპის გამოყენებით, ამრიგად ერთ რეაქციაში ხდება 8 ნიმუშის (7 ნიმუშის და ერთი ნეგატივ-კონტოლის) სექვენირება. ონკომაინის მონაცემთა ბაზის კომპიუტერულ პროგრამასთან დაკავშირებისას, მკვლევარს საშუალება ეძლევა შექმნას რეპორტი, რომელშიც მოინიშნება შესაბამისი ბმულები, მითითებები საერთაშორისოდ აღიარებული გაიდლაინებიდან და უკვე არსებული კვლევებიდან. ნაკრების ძირითადი მახასიათებლებია:

• 161 გენის ვარიანტების ანალიზი;
• დეტექცია: SNV, CNV, ქიმერული გენები, ინსერცია-დელეციები;
• უნაკლო შესრულება ნიმუშის ისეთი მცირე მოცულობიდან, როგორიცაა 40 ng ტოტალური ნუკლეინის მჟავები (დნმ/რნმ), რომლის გამოყოფა ხდება როგორც FFPE ნიმუშებიდან, ასევე წვრილი ნემსით ჩატარებული ბიოფსიის მასალიდან;
• შედეგების კონტროლი მოლეკულური სტანდარტების და კონტროლის საფუძველზე.

კატალოგის ნომერი: 4475346 Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან ("hot spot" მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™  სიმსივნური "Hotspot"-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:

• თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
• მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
• პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
• გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.

სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური "Hotspot"-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში. ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0 ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.