| გამოიყენება აპარატურასთან: | Ion PGM™ სისტემა |
| ბიბლიოთეკის ტიპი: | სამიზნე ბიბლიოთეკის სევენირება |
| პროტოკოლის ეტაპი: | სამიზნეების სელექცია |
| საწყისი მასალა: | დნმ |
| სექვენირების ტიპი: | გენომი და დნმ-სექვენირება |
| მულტიპლექსირების შესაძლებლობა: | 207 ამპლიკონი |
| პროდუქტის ხაზი: | Ion AmpliSeq™ |
| პროდუქტის ზომა: | 8 რეაქცია |
| ნიმუშის ტიპი: | სისხლი, უჯრედული კულტურები, კლინიკური ნიმუშები, დნმ (გენომური), ორ-ჯაჭვიანი დნმ (dsDNA), ბიოფსიის მასალა (FNA), ქსოვილი (FFPE), მთლიანი სისხლი |
| სამიზნე სახეობები: | ადამიანი |
| საწყისი მასალის მოცულობა: | 10 ng დნმ |
| ტექნიკა: | ამპლიკონების სექვენირება, Post-Light™ იონური ნახევარგამტარული სექვენირება |
სიმსივნური მარკერების პანელი Ion AmpliSeq™ v2
კატალოგის ნომერი: 4475346
Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან (“hot spot” მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™ სიმსივნური “Hotspot”-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:
- თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
- მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
- პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
- გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.
სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში
Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური “Hotspot”-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში.
ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0
ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.
აღწერა
მიმოხილვა (0)
მსგავსი პროდუქტები
Chef ნაკრები: Ion 510™ & Ion 520™ & Ion 530™ – (1 სექვენირების რეაქცია თითოეული ინიციალიზაციისას)
კატალოგის ნომერი: A34019
Ion 510 & Ion 520 & Ion 530 Chef-ნაკრები (1 სექვენირების რეაქცია თითოეული ინიციალიზაციისას) საშუალებას იძლევა ნიმუშის მომზადება განხორციელდეს ავტომატურად. Ion Chef სისტემით მომზადებული რიდების სიგრძე აღნიშნული ნაკრების შემთხვევაში შეადგენს 400 აზოტოვან ფუძეს, რომელთა სექვენირება ხორციელდება Ion S5 ან Ion S5 XL სექვენირების პლატფორმების საშუალებით. Ion 510/Ion 520/Ion 530 ნაკრები მოიცავს ერთჯერადი გამოყენებისთვის წიანასწარ მომზადებულ სექვენირების რეაქგენტების კარტრიჯს, რომელსაც ინტეგრირებული აქვს ნიმუშის კონტროლის, მიწოდების და ავტომატური პროტოკოლის მართვის ფუნქციები. ნაკრებით შესაძლებელია ჩიპებზე დატანილი 8 ნიმუშის სექვენირება. რეაქციის ყოველი ინიციალიზაციისას შესაძლებელია 1 სექვენირების რეაქციის ჩატარება. სექვენირების 2 რეაქციის გასაშვებად თითოეული ინიციალიზაციისას (200 აზოტოვანი ფუძე) იხილეთ ნაკრები: No. A34461.
Ion 510 / Ion 520 / Ion 530 Chef - ნაკრები:
- ნიმუშის მომზადება და ჩიპში ჩატვირთვა 400 აზოტოვან ფუძემდე სიგძის მქონე რიდებისთვის;
- სექვენირება გამარტივებულია ერთჯერადი, გამოყენებისთვის მზა ფორმის რეაგენტების კარტრიჯებით;
- სწრაფი და მარტივი სექვენირება, 15 წუთზე ნაკლები დრო ხელით სამუშაოდ;
- მაქსიმალური მოქნილობა ჩიპებთან თავსებადობის მხრივ: Ion 510, Ion 520, და Ion 530 ჩიპები.
FFPE ნიმუშებიდან ტოტალური ნუკლეინის მჟავების საექსტრაქციო ნაკრები RecoverAll™
კატალოგის ნომერი: AM1975
RecoverAll™ ტოტალური ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქციის ნაკრები FFPE ნიმუშებიდან განსაზღვრულია 40 რეაქციის შესასრულებლად და ხასიათდება:
- ოპტიმიზებული ტოტალური ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქიისთვის FFPE - ქსოვილებიდან, მიკრო რნმ-ების ჩათვლით;
- არ საჭიროებს 12 საათის განმავლობაში პროტეინაზა K-თი დამუშავებას, დეპარაფინიზაცია ხორციელდება რამოდენიმე საათში, ექსპერიმენტის დილით დაწყებისას ნაშუადღევს ნუკლეინის მჟავები მზად არის პჯრ რეაქციაში გასაშვებად;
- ექსტრაქციის ტიპიური გამოსავალი >50%;
- მიღებული ნუკლეინის მჟავები გამოიყენება ახალი თეობის სექვენირებისთვის, RT-PCR და PCR რეაქცაში გასაშვებად, მუტაციების სკრინინგისა და მიკროჩიპებით ანალიზისთვის.
Ion AmpliSeq™ Direct FFPE – დნმ ნაკრები
კატალოგის ნომერი: A31136
Ion AmpliSeq™ Direct FFPE - დნმ ნაკრებით შესაძლებელია დნმ-ნიმუშების მომზადება ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან. აღნიშნული ნიმუშები გამოიყენება ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის Ion AmpliSeq პროტოკოლის გამოყენებით. აღსანიშნავია, რომ დნმ-ის მისაღებად ქსოვილური ნიმუშების დეპარაფინიზაცია ამ შემთხვევაში საჭირო არ არის. კიტი თავსებადია FFPE ნიმუშებთან, რომელთა დაჭრა ხდება 10 µm სისქის ანათლებად.
Ion AmpliSeq Direct FFPE -დნმ ნაკრების მახასიათებლებს შორის აღსანიშნავია:
- მარტივი პროტოკოლი, რომელიც ნიმუშის დაკარგვის პრობლემას გამორიცხავს;
- ეფექტური 30-წუთიანი პროტოკოლი, მხოლოდ 10 წუთის ხანგრძლივობის ხელით სამუშაო დროით;
- იდეალურია FFPE დნმ-ნიმუშებდან დნმ-ის გამოსაყოფად, როდესაც ნიმუში ლიმიტირებული რაოდენობითაა;
- FFPE ანათლების დეპარაფინიზაცია არ არის საჭირო;
- სპინ- ან ბიდ-დამოკიდებული დნმ-ის ექსტრაქცია არ არის საჭირო;
- Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მომზადება ხდება მხოლოდ 1 ng დნმ-ნიმუშიდან;
- პროტოკოლი მოიცავს ნიმუშების ურაცილ-D-გლიკოზილაზათი დამუშავებას, რაც დეამინირებული ციტოზინის არიდან ელიმინაციის შესაძლებლობას ქმნის.
ბარკოდების ადაპტერების ნაკრები Ion Xpress™ 1-16
კატალოგის ნომერი: 4471250
Ion Xpress™ ბარკოდების ადაპტერების 1-16 ნაკრები მოიცავს 16 უნიკალურ ბარკოდის ადაპტერს, რომლებიც სპეციფიკურად შექმნილია და ვალიდირებულია Torrent PGM™ და Proton™ სექვენატორებზე რეაქციების ოპტიმალური შესრულებისთვის. როდესაც ნაკრები Ion Xpress™ Plus ან Ion Plus Fragment - ბიბლიოთეკის ფრაგმენტების მოსამზადებელ ნაკრებებთან კომპლექტში გამოიყენება, იგი მომხმარებელს საშუალებას აძლევს მოახდინოს ფრაგმენტთა 16-მდე ნაკრების მულტიპლექსირება ემულსიური პჯრ-ს ეტაპზე და შემდგომ მულტიპლექსური სექვენირება. ამ კიტის გამოყენება შესაძლებელია სხვა ბარკოდების ადაპტერების ნაკრებთან ერთად, რაც საბოლოო ჯამში ბიბლიოთეკის 96 ფრაგმენტის (96 სხვადახვა ნიმუშის) მულტიპლექსური სექვენირების შესაძლებლობას ქმნის. მოლეკულური ბარკოდების გამოყენება საშუალებას იძლევა განხორციელდეს სხვადასხვა დნმ-ფრაგმენტების მულტიპლექსირება სექვენირების ერთ ჩიპზე, რაც მაღალი წარმადობის და ეფექტურობის გარანტიაა.
ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები Ion AmpliSeq™ 2.0
კატალოგის ნომერი: 4480441
Ion AmpliSeq™ Library 2.0 ნაკრები შექმნილია ამპლიკოების ბიბლიოთეკის სწრაფი მომზადებისთვის, Ion AmpliSeq™ პანელების გამოყენებით.
ბარკოდირებული ბიბლიოთეკის მომზადება
Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები 2.0 მოიცავს რეაგენტებს ამპლიკონების გენერირებისთვის Ion AmpliSeq პრაიმერებით. ნაკრების საშუალებით ბარკოდირებული ბიბლიოთეკის მომზადებისთვის საჭიროა Ion Xpress™ ბარკორების ადაპტერების 1-96 ნაკრები ან IonCode™ ბარკორების ადაპტერების 1-384 ნაკრები. ბარკოდირებული ბიბლიოთეკა შესაძლოა ჩაიტვირთოს ერთ ჩიპში კომბინირებული ნიმუშების სახით, რაც სექვენირების დროის და ფასის მინიმალიზაციას განაპიროებებს.
მარტივი და მოქნილი პროტოკოლი
Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები 2.0 პლანშეტების ფორმატით ამარტივებს ნიმუშის მომზადებას და თავსებადია თანამედროვე ავტომატიზების და მაღალი წარმადობის სისტემებთან. ბიბლიოთეკის მომზადება საჭიროებს მეტად მცირე მოცულობის საწყის ნიმუშს პჯრ რეაქციისთვის. შედეგად მიღებული დნმ-ბიბლიოთეკა მზადაა ნიმუშის შემდგომი დამუშავებისთვის ავტომატიზებული Ion Chef™ სისტემის საშუალებით. ინტუიტიური Torrent Suite™ და Ion Reporter™ კომპიუტერული პროგრამები მიღებული მონაცემების ანალიზის ოპტიმიზაციის შესაძლებლობას ქმნის.
ჩიპის ნაკრები Ion 520™
კატალოგის ნომერი: A27762
Ion 520 ჩიპის ნაკრები მოიცავს 8 ბარკოდირებულ ჩიპს, რომლებიც გამიოყენება Ion S5 და Ion S5 XL სექვენირების სისტემებზე. Ion 520 ჩიპის გამოყენებით ელექტრონულად ხდება თითოეული ნუკლეოტიდის ჩართვის დეტექცია პოლიმერიზაციისას, ფლუორესცენტული სიგნალის გარეშე. ოპტიკაზე ორიენტირებული დეტექციის სისტემის თავიდან აცილება შემდეგი თაობის სექვენირების ტექნოლოგიას ანიჭებს სისწრაფეს. ამ შემთხვევაში, 200 bp სიგრძის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობის სექვენირების დრო 2.5 საათზე ნაკლებია.
Ion 520 ჩიპის ნაკრების მახასიათებლები:
- ნიმუშის კონტროლის ფუნქცია ინტეგრირებული ბარკოდის მეშვეობით;
- რეაქციის სისწრაფე: მხოლოდ 2.5 - 4 საათში 3-6 მლნ რიდის გენერირება;
- რიდების სიგრძე 600 აზოტოვან ფუძემდე მრავალი სხვადასხვა ტიპის ექსპერიმენტის შესრულების შესაძლებლობას ქმნის, მათ შორის გენთა მიზნობრივი სექვენირება და მიკრობთა სექვენირება;
- თავსებადობა ბიბლიოთეკის მომზადების თანამედროვე მეთოდებთან.
მიმოხილვა
მიმოხილვები ჯერ არ არის.