| გამოიყენება აპარატურასთან: | Ion PGM™ სისტემა |
| ბიბლიოთეკის ტიპი: | სამიზნე ბიბლიოთეკის სევენირება |
| პროტოკოლის ეტაპი: | სამიზნეების სელექცია |
| საწყისი მასალა: | დნმ |
| სექვენირების ტიპი: | გენომი და დნმ-სექვენირება |
| მულტიპლექსირების შესაძლებლობა: | 207 ამპლიკონი |
| პროდუქტის ხაზი: | Ion AmpliSeq™ |
| პროდუქტის ზომა: | 8 რეაქცია |
| ნიმუშის ტიპი: | სისხლი, უჯრედული კულტურები, კლინიკური ნიმუშები, დნმ (გენომური), ორ-ჯაჭვიანი დნმ (dsDNA), ბიოფსიის მასალა (FNA), ქსოვილი (FFPE), მთლიანი სისხლი |
| სამიზნე სახეობები: | ადამიანი |
| საწყისი მასალის მოცულობა: | 10 ng დნმ |
| ტექნიკა: | ამპლიკონების სექვენირება, Post-Light™ იონური ნახევარგამტარული სექვენირება |
სიმსივნური მარკერების პანელი Ion AmpliSeq™ v2
კატალოგის ნომერი: 4475346
Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან (“hot spot” მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™ სიმსივნური “Hotspot”-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:
- თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
- მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
- პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
- გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.
სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში
Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური “Hotspot”-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში.
ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0
ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.
აღწერა
მიმოხილვა (0)
მსგავსი პროდუქტები
GeneJET Micro ნაკრები რნმ-ის გასუფთავებისა და კონცენტრირებისთვის
კატალოგის ნომერი: K0842
აღწერა:
Thermo Scientific GeneJET რნმ-ის გასუფთავების და კონცენტრირების მიკრო ნაკრები შექმნილია წინასწარ გამოყოფილი რნმ-ის ნიმუშების სწრაფი გასუფთავებისა და კონცენტრირებისთვის, ასევე DNase I-ით დამუშავების შემდგომ და სხვა ფერმენტებისგან რნმ-ის ნიმუშების გასაწმენდად. კიტი შექმნილია სილიკა-მემბრანის მქონე სპინ-სინჯარების ტექნოლოგიაზე დაყრდნობით, რაც გამორიცხავს ექსპერიმენტისას ტოქსიკური რეაქგენტების გამოყენების საჭიროებას.
მახასიათებლები:
- სინჯარების დახვეწილი და მარტივად გამოსაყენებელი დიზაინი;
- ელუცია: 6 - დან 10 µL მოცულობამდე.
- 85-დან100%-მდე მაღალი ხარისხის რნმ-ის მიღების შესაძლებლობა;
- სწრაფი და მარტივი - პროცედურა 5 წუთზე ნაკლებ დროს საჭიროებს.
- RT-PCR, RT-qPCR, Northern - ბლოტინგი და სხვა რნმ-დამოკიდებული ექსპერიმენტები.
Ion – ბიბლიოთეკის დამაბალანსებელი ნაკრები
კატალოგის ნომერი: 4482298
Ion Library Equalizer™ ნაკრები მარტივი გადაწყვეტილებაა სექვენირების ბიბლიოთეკის რაოდენობრივი ანალიზისა და მისი განზავებისთვის, ასევე ბიბლიოთეკის ნორმალიზაციისათვის, რაც განსაზღვრულია ნებისმიერი ახალი თაობის სექვენირების პროტოკოლით. Ion Library Equalizer™ ნაკრები ამცირებს შესასრულებელი სამუშაოს სირთულეს, რეაგენტების ფასებს და ამარტივებს იონურ ნახავარგამტარ მეთოდოლოგიაზე დაფუძნებული სექვენირების პროტოკოლს. შედეგად მიიღება ბარკოდირებული ნიმუშები მაღალი წარმადობით. ნაკრების გამოყენება ასევე შესაძლებელია ერთი ან რამოდენიმე ნიმუშის მოსამზადებლად, მცირე მოცულობით.
ნაკრების პროტოკოლი მოიცავს 3 მარტივ ეტაპს:
1) ბიბლიოთეკის ამპლიფიკაცია Equalizer™-პრაიმერებით;
2) ბიბლიოთეკის დაკავშირება Equalizer™-ბიდებთან;
3) ელუციის ეტაპი - ნორმალიზებული ბიბლიოთეკის გაცხელება და ელუცია სპეციალურად მომზადებული Equalizer™ ელუციის ბუფერით.
ეფექტური ფასი
- არ არის საჭირო დამატებითი ტექნიკა;
- უფრო დაბალი ფასი, ვიდრე Agilent 2100 Bioanalyzer®-ის შემთხვევაში;
- გამოყენების ვადა - 18 თვემდე.
- Ion AmpliSeq™ Library Kit 2.0
- Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა პანელი ან მომხმარებილის მიერ Ion AmpliSeq™ Designer (www.ampliseq.com) -ით შექმლინი პანელი.
- Ion Plus ბიბლიოთეკის ფრაგმენტების მოსამზადებელი ნაკრები
- Ion Xpress™ Plus ბიბლიოთეკის ფრაგმენტების მოსამზადებელი ნაკრები
- Ion Xpress™ - ბარკოდების ადაპტერების ნაკრები
MagMAX™ დნმ-ის ექსტრაქციის ნაკრები
კატალოგის ნომერი: A25597
MagMAX™ DNA - სხვადასხვა ტიპის ნიმუშდან დნმ-ის გამოყოფისთვის ოპტიმიზებული ტექნოლოგიით. ნაკრებით ხორციელდება გენომური დნმ-ის (gDNA) ექსტრაქცია ისეთი ტიპის ნიმუშებიდან, როგორიცაა სისხლი, ეპითელური უჯრედები, ნერწყვი, შარდი, სისხლის ნიმუშის ფირფიტები, პირის ღრუს სითხეები და ქსოვილები. მაგნიტურ ბიდებზე დაფუძნებული ექსტრაქციის სისტემა შესაძლებელს ხდის დღის განმავლობაში გაკეთდეს ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქცია 12-დან 500-მდე ნიმუშიდან. ექსტრაქციის ნაკრები იდეალურია ფარმაკოგენომიკური კვლევებისთვის (PGx).
MagMAX™ DNA Multi-Sample Ultra - ნაკრები ხასიათდება:
- მარტივი პროტოკოლი დნმ-ის ექსტრაქციისთვის სხვადასხვა ტიპის ბიოლოგიური ნიმუშებიდან;
- ოპტიმიზებული დნმ-ის მაღალი წარმადობით ექსტრაქციისთვის, თავსებადი OpenArray® და Ion AmpliSeq™ აპლიკაციებთან;
Oncomine™ BRCA საკვლევი ნაკრები, ბიბლიოთეკის მომზადება Ion-Chef სისტემით
კატალოგის ნომერი: A32841
Oncomine™ BRCA კველვითი ნაკრები მოიცავს AmpliSeq™ პრაიმერთა ოლიგონუკლეოტიდების 2 ნაკრებს და საჭირო რეაგენტებს, რომლებიც Ion Torrent™ ახალი თაობის სექვენირების პლატფორმებზე ამპლიკონთა ბიბლიოთეკების გენერირებისთვის გამოიყენება. ნაკრები შექმნილია ნიმუშების სენსიტიური და სრულყოფილი ამპლიფიკაციისთვის. ანალიზი მოიცავს ადმიანის BRCA1 და BRCA2 გენების ყველა მაკოდირებელ მონაკვეთს. ექსპერიმენტის აღნიშნული ვერსია გათვლილია NGS ბიბლიოთეკის ავტომატური მომზადებისთვის, Ion Chef™ სისტემის გამოყენებით. ბიბლიოთეკის მანუალური მომზადებისთვის იხილეთ ნაკრები კატალოგის ნომრით: A32840. ნაკრების მახასიათებლები:- ვალიდირებულია Ion 318 და Ion 530 ჩიპებთან კომპლექტში გამოყენებისთვის;
- შესაძლებლობები: SNVs, InDels და დიდი ზომის ექსონების/გენთა დელეციების/დუპლიკაციების დეტექცია;
- თავსებადია დნმ-ის ისეთ მცირე მოცულობებზე მუშაობისას, როგორიცაა ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან ან სისხლის ნიმუშებიდან გამოყოფილი 10 ნგ დნმ;
- სრულყოფილი დაფარვა მაკოდირებელი მონაკვეთების - ექსონების და სპლაისინგის საიტების დეტექციის მხრივ, ეფექტური სექვენირებისა და აკურატული ანალიზისთვის;
- პრაიმერების ოპტიმიზებული დიზაინი და ამპლიფიკაციის რეაგენტები, რომლებიც სამიზნის მაღალსპეციფიური ექსტრაქციის საშუალებას ქმნის;
- 5%-იანი და უფრო მცირე მასშტაბის სომატური ვარიანტების ვალიდირებული დეტექცია;
- მარტივი და სწრაფი პროტოკოლის მეშვეობით ბიბლიოთეკა მზადაა 3.5 საათში.
ბარკოდების ადაპტერების ნაკრები Ion Xpress™17-32
კატალოგის ნომერი: 4474009
Ion Xpress™ ბარკოდების 17-32 ადაპტერების ნაკრები მოიცავს 16 უნიკალურ ბარკოდის ადაპტერს, რომლებიც სპეციფიკურად შექმნილია და ვალიდირებულია Torrent PGM™ და Proton™ სექვენატორებზე რეაქციების ოპტიმალური შესრულებისთვის. როდესაც ნაკრები Ion Xpress™ Plus ან Ion Plus Fragment - ბიბლიოთეკის ფრაგმენტების მოსამზადებელ ნაკრებებთან კომპლექტში გამოიყენება, იგი მომხმარებელს საშუალებას აძლევს მოახდინოს ფრაგმენტთა 16-მდე ნაკრების მულტიპლექსირება ემულსიური პჯრ-ს ეტაპზე და შემდგომ მულტიპლექსური სექვენირება. ამ კიტის გამოყენება შესაძლებელია სხვა ბარკოდების ადაპტერების ნაკრებთან ერთად, რაც საბოლოო ჯამში ბიბლიოთეკის 96 ფრაგმენტის (96 სხვადახვა ნიმუშის) მულტიპლექსური სექვენირების შესაძლებლობას ქმნის. მოლეკულური ბარკოდების გამოყენება საშუალებას იძლევა განხორციელდეს სხვადასხვა დნმ-ფრაგმენტების მულტიპლექსირება სექვენირების ერთ ჩიპზე, რაც მაღალი წარმადობის და ეფექტურობის გარანტიაა.
ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები Ion AmpliSeq™ 2.0
კატალოგის ნომერი: 4480441
Ion AmpliSeq™ Library 2.0 ნაკრები შექმნილია ამპლიკოების ბიბლიოთეკის სწრაფი მომზადებისთვის, Ion AmpliSeq™ პანელების გამოყენებით.
ბარკოდირებული ბიბლიოთეკის მომზადება
Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები 2.0 მოიცავს რეაგენტებს ამპლიკონების გენერირებისთვის Ion AmpliSeq პრაიმერებით. ნაკრების საშუალებით ბარკოდირებული ბიბლიოთეკის მომზადებისთვის საჭიროა Ion Xpress™ ბარკორების ადაპტერების 1-96 ნაკრები ან IonCode™ ბარკორების ადაპტერების 1-384 ნაკრები. ბარკოდირებული ბიბლიოთეკა შესაძლოა ჩაიტვირთოს ერთ ჩიპში კომბინირებული ნიმუშების სახით, რაც სექვენირების დროის და ფასის მინიმალიზაციას განაპიროებებს.
მარტივი და მოქნილი პროტოკოლი
Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მოსამზადებელი ნაკრები 2.0 პლანშეტების ფორმატით ამარტივებს ნიმუშის მომზადებას და თავსებადია თანამედროვე ავტომატიზების და მაღალი წარმადობის სისტემებთან. ბიბლიოთეკის მომზადება საჭიროებს მეტად მცირე მოცულობის საწყის ნიმუშს პჯრ რეაქციისთვის. შედეგად მიღებული დნმ-ბიბლიოთეკა მზადაა ნიმუშის შემდგომი დამუშავებისთვის ავტომატიზებული Ion Chef™ სისტემის საშუალებით. ინტუიტიური Torrent Suite™ და Ion Reporter™ კომპიუტერული პროგრამები მიღებული მონაცემების ანალიზის ოპტიმიზაციის შესაძლებლობას ქმნის.
ჩიპის ნაკრები Ion 520™
კატალოგის ნომერი: A27762
Ion 520 ჩიპის ნაკრები მოიცავს 8 ბარკოდირებულ ჩიპს, რომლებიც გამიოყენება Ion S5 და Ion S5 XL სექვენირების სისტემებზე. Ion 520 ჩიპის გამოყენებით ელექტრონულად ხდება თითოეული ნუკლეოტიდის ჩართვის დეტექცია პოლიმერიზაციისას, ფლუორესცენტული სიგნალის გარეშე. ოპტიკაზე ორიენტირებული დეტექციის სისტემის თავიდან აცილება შემდეგი თაობის სექვენირების ტექნოლოგიას ანიჭებს სისწრაფეს. ამ შემთხვევაში, 200 bp სიგრძის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობის სექვენირების დრო 2.5 საათზე ნაკლებია.
Ion 520 ჩიპის ნაკრების მახასიათებლები:
- ნიმუშის კონტროლის ფუნქცია ინტეგრირებული ბარკოდის მეშვეობით;
- რეაქციის სისწრაფე: მხოლოდ 2.5 - 4 საათში 3-6 მლნ რიდის გენერირება;
- რიდების სიგრძე 600 აზოტოვან ფუძემდე მრავალი სხვადასხვა ტიპის ექსპერიმენტის შესრულების შესაძლებლობას ქმნის, მათ შორის გენთა მიზნობრივი სექვენირება და მიკრობთა სექვენირება;
- თავსებადობა ბიბლიოთეკის მომზადების თანამედროვე მეთოდებთან.
მიმოხილვა
მიმოხილვები ჯერ არ არის.