AgriSeq genotyping-by-sequencing (GBS)
Applied Biosystems AgriSeq HTS Library Kit სპეციფიურად დადიზაინებულია ამპლიკონების ბიბლიოთეკების მაღალი წარმოებისათვის და მიზნობრივი გენოტიპირებისათვის სექვენირების გზით (GBS).
Agrigenomics Solutions for Aquaculture
Thermo Fisher Scientific გთავაზობთ გენოტიპირებას, რომლებიც შეიძლება დადიზაინდეს მარტივი და კომპლექსური მოზაიკური გენომებით, რომლებიც გვხვდება ეკონომიკურად მნიშვნელოვან აკვაკულტურულ სახეობებში, მაგალითისათვის როგორებიცაა კრევეტები, ორაგული და მოლუსკები .
შექმენით თქვენს საჭიროებებზე მორგებული კვლევები.
აღწერა
მიმოხილვა (0)
მსგავსი პროდუქტები
2 x 96-ფოსოიანი ProFlex™ პჯრ-სისტემა
კატალოგის ნომერი: 4484076
ProFlex™ 2x96- ფოსოიანი პჯრ სისტემა უახლესია Applied Biosystems - ის თერმოციკლერებს შორის.
ProFlex™ სისტემა Applied Biosystems®-ის სხვა აპარატურის მსგავსად, იძლევა სანდო მონაცემებს, მოქნილ კონფიგურაციას და ექსპერიმენტის მართვის შესაძლებლობებს, რომლებიც იდეალურად შეესაბამება ჩვენი კვლევის საჭიროებებს.
ProFlex™ 2x96-ფოსოიანი პჯრ სისტემა საშუალებას გვაძლევს:
-საჭიროების შემთხვევაში 2x96-ფოსოიანი 0.2 მლ ბლოკის სხვა ტიპის ბლოკით ჩანაცვლების შესაძლებლობა;
-სისტემასთან დისტანციური წვდომა მობილურის აპლიკაციის საშუალებით;
-ინსტრუმენტის პროგრამირების შესაძლებლობა წამებში, მრტივად გამოყენებადი სენსორული ეკრანით;
-ძველ თერმოციკლერზე არსებული პროტოკოლის გამოყენების შესაძლებლობა.
96-ფოსოიანი თერმოციკლერი Veriti™
კატალოგის ნომერი: 4375786
Applied Biosystems® Veriti® 96-ფოსოიანი თერმოციკლერი Applied Biosystems® ის სხვა აპარატურის მსგავსად იძლევა სანდო მონაცემებს.
VeriFlex™ ტექნოლოგიის დამატებითი კონტროლის საშუალებით, მიიღება 6 დამოუკიდებელი ტემპერატურული ბლოკი, რაც უზრუნველყოფს ზედმიწევნით სიზუსტეს და პჯრ-რეაქციის ოპტიმიზაციას. ამავდროულად, ფერადი სენსორული ეკრანი ამარტივებს რეაქციის დადგმის და თერმოციკლერის გამოყენების პროცესს. სწრაფი და სტანდარტული პჯრ რეაქციის არჩევის ფუნქცია საშუალებას გვაძლევს შევამციროთ პჯრ-რეაქციის ციკლირების დრო.
Veriti® 96-ფოსოიანი თერმოციკლერი აღჭურვილია სტანდარტული 0.2 მლ-იანი ბლოკით. ინოვაციური VeriFlex™ ბლოკები პჯრ-ის ოპტიმიზაციის და 6 დამოუკიდებელი ექსპერიმენტის გაშვების საშუალებას გვაძლევს.
Veriti™ - ძირითადი მახასიათებლები:
VeriFlex™ ბლოკები - Veriti® 96-ფოსოიანი თერმოციკლერის ინოვაციური VeriFlex™ ბლოკები აუმჯობესებს პჯრ-ის წარმადობას.
6 განცალკევებული ბლოკის საშუალებით გაზრდილია აპარატის შესაძლებლობები, რაც გამოიხატება 2 ძირითად უპირატესობაში:
- პჯრ-ის ოპტიმიზაცია: თითოეული ბლოკის სპეციფიკური ტემპერატურა იდეალურია და პჯრ-ის ოპტიმიზაციისა და ზუსტი კონტროლისთვის.
- მეტი რეაქციის გაშვების შესაძლებლობა: 6 ბლოკის საშუალებით შესაძლოა განხორციელდეს 6 სხვადასხვა ანელინგის ტემპერატურის მქონე ნიმუშის ამპლიფიკაცია ერთ რანში.
Ion Chef სისტემა
კატალოგის ნომერი: 4484177
Ion Chef სისტემა ახალი თაობის სექვენირების პროტოკოლის გამარტივების შესაძლებლობას ქმნის Ion S5, Ion Proton და Ion PGM სისტემებთან ერთად გამოყენებისას. Ion Chef პლატფორმა უზრუნველყოფს ბიბლიოთეკის ავტომატურ მომზადებას, მატრიცის მომზადებას და ჩიპის ჩატვირთვას ავტომატურ რეჟიმში.
Ion Chef სისტემა საჭიროებს ხელით მუშაობის მხოლოდ 15 წუთიანი პროტოკოლის შესრულებას. მზა რეაგენტებით, ბიბლიოთეკის მოსამზადებისას საჭირო დრო მინიმუმამდეა შემცირებული. ავტომატიზებული პროტოკოლი AmpliSeq one- და two-ნაკრებების დიზაინის საშუალებას იძლევა.
Ion Chef სისტემა მნიშვნელოვნად ზრდის პროდუქტიულობას.
იხილეთ www.AmpliSeq.com თქვენთვის საინტერესო პანელების დიზაინისთვის.
Ion Chef სისტემა:
• ამარტივებს პროტოკოლს;
• ამცირებს შრომის და დახარჯული დროის მაჩვენებელს
• სისტემა აერთიანებს ბიბლიოთეკის მომზადების ყველა ეტაპს: სპეციფიკური პჯრ ამპლიფიკაცია შესაბამისი პრაიმერების პანელით, ადაპტერების/ბარკოდების ლიგირება, გასუფთავება, ბიბლიოთეკის მომზადება და საბოლოდ ნიმუშის ჩიპში ჩატვირთვა.
Ion GeneStudio™ S5 Plus სისტემა
კატალოგის ნომერი: A38195
Ion GeneStudio S5 Plus სისტემა წარმოადგენს ნახევარგამტარ-პრინციპზე დაფუძნებულ ახალი თაობის სექვენირების (NGS) სისტემას, რომელიც საშუალებას იძლევა სექვენირება განხორციელდეს სწრაფი და მიზნობრივი პროტოკოლებით;
Ion GeneStudio S5 Plus სისტემა ლაბორატორიებს საშუალებას აძლევს განახორციელონ მცირე თუ დიდი მასშტაბის პროექტები სხვადასხვა მიმართულებით, მათ შორის ონკოლოგიური კვლევები და შედარებით იშვიათად გამოყენებადი ექსპერიმენტები. კარტრჯის ფორმატის რეაგენტებით, სისტემა მარტივია გამოსაყენებლად და ამავდროულად გვთავაზობს მასშრაბურობას და მოქნილობას.
პლატფორმა იყენებს Ion 5 სერიის ჩიპებს ფართო სპექტრის, მაღალი წარმადობის სექვენირების ექსპერიმენტების ჩასატარებლად როგორც კლინიკური, ასევე სამეცნიერო მიზნებისთვის, მათ შორის მიკრობთა გენომების სექვენირება, გენური პანელების, ექსონების და ტრანსკრიპტომების სექვენირება.
Ion Torrent targeted next-generation sequencing (NGS)
Ion Torrent targeted next-generation sequencing (NGS) ტექნოლოგია უზრუნველყოფს ოპტიმიზირებულ სამუშაო პროცესს სრული ვირუსული გენომის სექვენირებისთვის და იძლევა SARS-CoV-2 ვარიანტების იდენტიფიცირების საშუალებას ეპიდემიოლოგიური კვლევებისთვის.
The Ion AmpliSeq SARS-CoV-2 Insight Research Assay შედგება ორი პულისგან, ამპლიკონების სიგრძის დიაპაზონით - 125 წყვილი ნუკლეოტიდიდან 275 წყვილ ნუკლეოტიდამდე, რაც ფარავს SARS-CoV-2-ის გენომის 99%-ს, ყველა სეროტიპის ჩათვლით.
ადამიანის გენოტიპირება, ფარმაკოგენომიკა და მიკრობიომების კვლევა მიკროჩიპების გამოყენებით
Axiom - გენოტიპირების სისტემა არის პლატფორმა დიდი მასშტაბის გენოტიპირების კვლევებისთვის და ხასიათდება მთელი რიგი უპირატესობებით, მათ შორის:
სამედიცინო კვლევები მაღალი სიზუსტით
ფართო სპექტრის შესაძლებლობების მქონე, პოპულაციურ კვლევებზე ორიენტირებული ტესტ-სისტემა ხასიათდება მაქსიმალური სიზუსტით სამედიცინო მნიშვნელობის კვლევებისას; მასშტაბურ გენომურ კვლევებზე გათვლილი სისტემა მოიცავს კლინიკურად ინფორმატიულ მარკერებს; გენეტიკასა და დაავადებათა განვითარებას შორის კავშირის დადგენის შესაძლებლობა.
პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის (პჯრ) მეთოდი
რა არის პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის (პჯრ) მეთოდი?
პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქცია (პჯრ/PCR) წარმოადგენს მეთოდს, რომლის საშუალებით ნუკლეინის მჟავის სპეციფიკური მონაკვეთის მილიონობით ასლის მიღება არის შესაძლებელი, რაც სამიზნის დეტექციის საშუალებას იძლევა თუნდაც მისი უმცირესი კონცენტრაციისას საკვლევ ნიმუშში.
მეთოდი შემუშავდა 1983 წელს Kary Mullis-ის მიერ, რისთვისაც მან ნობელის პრემია დაიმსახურა ქიმიის დარგში. მეთოდის შემქნიდან დღემდე პჯრ ფართოდ გამოიყენება მრავალ სამედიცინო და სამეცნიერო დისციპლინაში, მათ შორის მოლეკულური დიაგნოსტიკის, მიკრობიოლოგიის, გენეტიკის, კლინიკური დიაგნოსტიკის, სასამართლო ექსპერტიზის, გარემოს დაცვითი მეცნიერებების, მემკვიდრეობითი კვლევებისას და მშობლის იდენტიფიკაციისთვის.
მეთოდის სახელი გამომდინარეობს დნმ-ის რეპლიკაციისთვის აუცილებელი კომპონენტის, ფერმენტი დნმ-პოლიმერაზას სახელწოდებიდან. აღნიშნული ფერმენტი არსებობს ბუნებაში. ყველაზე გავრცელებულ პოლიმერაზას Taq-პოლიმერაზა წარმოადგენს, რომელიც მიიღება ბაქტერიიდან Thermus aquaticus. ფერმენტის მოქმედებისთვის ოპტიმალური ტემპერატურა დაახლოებით 70oC-ია. ფერმენტი ახდენს დნმ-ის ახალი ჯაჭვის სინთეზს დნმ-მატრიცაზე, დნმ-ის ოლიგო-ნუკლეოტიდების (პრაიმერების) გამოყენებით. პრაიმერები წარმოადგენს სინთეზურ ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობებს, რომლებიც კომპლემენტურია უშუალოდ სამიზნე დნმ-ის ბოლოებისა.
მოლეკულური ბიოლოგიის მეთოდების უახლესი მიღწევების და განვითარების ფონზე, შეიძლება ითქვას, რევოლუცია განიცადა ორგანიზმთა პათოგენური მოკროორგანიზმების, ვირუსების დეტექციისა და დახასიათების, გენეტიკური ცვლილებების კლინიკური დიაგნოსტიკის მიდგომებმა. აღნიშნულმა რევოლუციურმა ცვლილებამ გარდა ვირუსოლოგიისა, მიკოლოგიისა, და პარაზიტოლოგიისა, გავლენა იქონია სტომატოლოგიის, ჰემატოლოგიის, ონკოლოგიის, პერინატოლოგიის და მედიცინის სხვა მარავალი დარგის სადიაგნოსტიკო მიდგომების დახვეწასა და სიზუსტეზე.
პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქცია (პჯრ) უნაკლო მეთოდია პათოგენების სწრაფი დეტექციისთვის, რაც განსაკუთრებით მნიშვნელობას იძენს ისეთ ინფექციურ აგენტებთან მიმართერბაში, რომელთა იდენტიფიცირება საჭიროებს კულტივირებას ტრადიციული მიკრობიოლოგიური მიდგომით, რაც ხშირად პრობლემას წარმოადგენს, ან მოითხოვს დიდ დროს საბოლოო დიაგნოზის მისაღებად.
რეალურ დროში პჯრ-ის განვითარებამ, თვისობრივთან ერთად რაოდენობრივი და გენოტიპირების მონაცემების გენერაციის შესაძლებლობით, აღნიშნული მეთოდი კიდევ უფრო ინფორმატიული გახადა.
პჯრ ფართოდ გამოიყენება კლინიკური ნიმუშების ანალიზისთვის, ისეთი ინფექციური აგენტების დეტექციისთვის, როგორიცაა HIV, ჰეპატიტები, ადამიანის პაპილომა ვირუსი, ეპშტეინ ბარის ვირუსი, მალარიის და ჯილეხის გამომწვევი პათოგენები. პჯრ-ს განსაკუთრებული მნიშვნელობა აქვს HIV -ის ადრეული დეტექციისთვის, ვინაიდან ვირუსის დნმ-ის დეტექცია შესაძლებელია ორგანიზმის ინფიცირებისთანავე, განსხვავებით იმუნოლოგიური მეთოდებისგან, რომელთა საშუალებით ანტისხეულების დეტექცია შესაძელებლია ინფიცირებიდან კვირების და თვეების გასვლის შემდეგ. პჯრ შესაძლოა ასევე გამოყენებულ იქნას, ვირუსული ინფექციის სიმძიმის შესაფასებლად, რასაც დიაგნოსტიკისა და პროგნოზისთვის უდიდესი მნიშვნელობა გააჩნია.
მალარიის ტრადიციული დიაგნოსტიკა ხორციელდება მალარიის პლაზმოდიუმის (Plasmodium falcipurum) დეტექციით, სისხლის მიკროსკოპიული გამოკვლევით. აღნიშნულ შემთხვევაში პჯრ-ის საშუალებით შესაძლებელია დადგინდეს არა მარტო არსებობა, არამედ განისაზღვროს მისი გენოტიპი და შეირჩეს პრეპარატი, რომლის მეშვეობითაც შესაძლებელი იქნება დაავადების ეფექტური მკურნალობა. ინფექციური აგენტის ტიპის დადგენა განსაკუთრებით მნიშვნელოვანია შერეული ინფექციებისას.
სიმსივნის კლინიკურ დიაგნოსტიკაში პჯრ მეთოდი იძლევა მეტად მნიშვნელოვან ინფორმაციას პაციენტების პროგნოზისა და მათი რეზისტენტობის შესახებ თერაპიის ამა თუ იმ ტიპის მიმართ. სიმსვნეთა მრავალი ტიპი ხასიათდება წერტილოვანი მუტაციებით სხვადასხვა გენში, რომელთა იდენტიფიკაცია შესაძლებელია აღნიშნული მეთოდით. მაგალითად, ლეიკემიების განვითარების მიზეზი ძირითადად ქრომოსომული უბნების ტრანსლოკაციებია, რომლის შედეგადაც უჯრედები უკონტროლოდ იწყებენ პროლიფერაციას და ითრგუნება მათი გენეტიკურად პროგრამირებული სიკვდილი (აპოპტოზი). დაავადების დიაგნოსტირებისთვის ხშირად ტარდება ციტოგენეტიკური კვლევა ფილადელფიური ქრომოსომის გამოსაკვლევად. თუმცა აღსანიშნავია, რომ დაავადების საწყის ეტაპზე ფილადელფიურ ქრომოსომას ბევრი უჯრედი არ შეიცავს, რის გამოც მისი იდენტიფიცირება განვითარების ადრეულ სტადიაზე შეუძლებელია. ლეიკემიების გამოვლენა მათი განვითარების ადრეულ სტადიებზე შესაძლებელია პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციით.
აღსანიშნავია პჯრ მეთოდის გამოყენება გენეტიკური დაავადებების დიაგნოსტიკისთვის, როგორიცაა ცისტური ფიბროზი, თრომბოფილიები, ნამგლისებურ უჯრედოვანი ანემია, ფენიკლკეტონურია, კუნთოვანი დისტროფიები. ამავე მეთოდით შესაძლებელია ნაყოფის სქესის და მისი რეზუს (Rh) სტატუსის დადგენა ორსულობის მე-10 კვირაზე.
პჯრ მეთოდი გამოიყენება როგორც კაპილარული ელექტროფორეზის, ასევე შემდეგი თაობის სევქნირების ნიმუშების მომზადების ეტაპებზე.
პჯრ მეთოდის პრინციპი - ექსტრაქციის ეტაპი
ანალიზის განხორციელების პირველ ეტაპზე საჭიროა დნმ-ის (ან რნმ-ის) გამოყოფა ნიმუშიდან, რისთვისაც შემოთავაზებულია მზა ნაკრებები ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქციისთვის. ექსტაქციის ეტაპი მოიცავს რამოდენიმე საფეხურს: ნიმუშში (ქსოვილი, შრატი, სისხლი, შარდი, ნაცხი და ა.შ.) არსებული ცილების ლიზისი, მათი მოცილება გამრეცხი ბუფერების საშუალებით, სუფთა ნუკლეინის მჟავების მიღება ელუციის ეტაპზე.
პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის ლაბორატორია მოიცავს სამ დამოუკიდებელ ზონას:
1.ნიმუშების დასამუშავებელი და ნუკლეინის მჟავების საექსტრაქციო არე;
2.პრე-პჯრ: მასტერიმიქსის და ნიმუშების შესარევი არე;
3.პოლიმერაზული ჯაჭვური რეაქციის ოთახი.
თითოეული ზონა კონტამინაციის თავიდან ასაცილებლად აღჭურვილი უნდა იყოს UV ნათურით.
ტრანსკრიპტომების პროფილირება მიკროჩიპების გამოყენებით
ფენოტიპური პათოლოგიები იშვიათად არის გამოწვეული ერთი გენის ექსპრესიის ცვლილების შედეგად, ამიტომ ექსპრესიის სრულყოფილი პროფილის მიღება და მისი ანალიზი კრიტიკული მნიშვნელობისაა ნორმალური ბიოლოგიური პროცესის თუ მისი პათოლოგიური ცვლილებების შესწავლისას. გარდა ამისა, ექსპრესიის მნიშვნელოვანი ცვლილებები, როგორიცაა განსხვავებული ექსონის ჩართვა ალტერნატიული სპლაისინგისას, შესაძლოა არ გამოვლინდეს გენთა დონეზე ჩატარებული ანალიზისას. მიკრო-ჩიპების გამოყენება გვთავაზობს მთელ რიგ უპირატოსობებს მილიონობით სხვადასხვა სექვენსის ანალიზისთვის, რაც განსაკუთრებით მნიშვნელოვანია ალტერნატიული სპლაისინგის შესწავლისას.
რნმ-ის ექსპრესიის ანალიზისას, შემოთავაზებული ტესტ-სისტემების ფართო სპექტრი შესაძლოა მოიცავდეს როგორც სრულ ტრანსკრიპტომს, ასევე გენთა, ექსონთა ან მოკლე არამაკოდირებელ რნმ-თა (snc) ანალიზს. Affimetrix-ის ექსპრესიის ყველა ტესტ-სისტემა თავსებადია ფართო სპექტრის ნიმუშის ტიპებთან და საჭიროებს რნმ-ის ნიმუშის მცირე მოცულობას. ტესტ-სისტემები ხელმისაწვდომია როგორც ერთ-ნიმუშიანი კარტრიჯის ფორმატში, ასევე მრავალი ნიმუშის მომცველი პლანშეტების ფორმატში, განსხვავებული წარმადობისთვის. შედეგების ანალიზისთვის გამოიყენება სწრაფი და მოქნილი ანალიზის პროგრამა დამატებითი დანახარჯების გარეშე.
მიმოხილვა
მიმოხილვები ჯერ არ არის.