GeneJET Micro ნაკრები რნმ-ის გასუფთავებისა და კონცენტრირებისთვის

კატალოგის ნომერი: A30011

Ion 540™ Chef-ნაკრები საშუალებას იძლევა სექვენირებისთვის საჭირო ნიმუში მომზადდეს ავტომატიზებულ რეჟიმში. ნაკრები გათვლილია 200 აზოტოვანი ფუძის სიგრძის ფრაგმენტების ბიბლიოთეკის მოსამზადებლად, რომელთა სექვენირება მომდევნო ეტაპზე ხორციელდება Ion S5™ ან Ion S5™ XL სექვენირების პლატფორმებზე. Ion 540 ნაკრები მოიცავს წინასწარ დაკომპლექტებულ რეაგენტების კარტრიჯს,  რომელსაც ინტეგრირებული აქვს ნიმუშის კონტროლის, მიწოდების და ავტომატური პროტოკოლის მართვის ფუნქციები. ნაკრებით შესაძლებელია ჩიპებზე დატანილი 8 ნიმუშის სექვენირება. ნაკრები შეიცავს საკმარის რეაგენტებს 4 ინიციალიზაციისა და 8 სექვენირების რეაქციისთვის Ion S5 ან Ion S5 XL სისტემებზე.   Ion 540 ნაკრები Ion Chef და Ion S5/Ion S5 XL სისტემებისთვის:

• უზრუნველყოფს მატრიცების მომზადებას და ჩიპის ჩატვირთვას, ბიბლიოთეკის რიდების სიგრძე 200 აზოტოვანი ფუძე;
• ამარტივებს კვლევას გამოყენებისთვის მზა, ერთჯერადი რეაგენტების კარტრიჯებით;
• სწრაფი და მარტივი პროტოკოლი, 15 წუთზე ნაკლები დრო რეაქციის მოსამზადებლად;
• მიღებული აკურატული მონაცემები აუმჯობესებს შედეგების ანალიზის და ინტერპრეტაციის შესაძლებლობებს.

Catalog number:  4462359 The Applied Biosystems® MagMAX™ Pathogen RNA/DNA Kit enables purification of RNA and DNA from viruses and easy-to-lyse bacteria and parasites, using magnetic particle technology in a 96-well format. PCR inhibitors are effectively removed in the process, making the resulting nucleic acid ideal for real-time PCR and RT-PCR applications. Key Features:

• Convenience and flexibility: one kit for RNA and DNA, suitable for a wide range of sample types sample input volumes
• Increased confidence in your results: fewer false-negatives due to effective PCR inhibitor removal
• Improved workflow efficiency: process 96 samples in approximately 45 minutes using the MagMAX™ Express-96 Deep Well Magnetic Particle Processor

The MagMAX™ Pathogen RNA/DNA Kit has been optimized to provide a convenient, flexible solution (Fig. 1). This single kit can accomodate:

• Purification of RNA and DNA
• Purification from viruses and easy-to-lyse bacteria and parasites
• Low and high sample input volumes

A wide range of sample types:

• Low cell content samples (e.g., serum and plasma; nasal, tracheal, and cloacal swabs; ear notches)
• Whole blood
• Semen
• Oral fluid
• Feces
• Biomed Diagnostics InPouch™ TF (Tritrichomonas foetus) culture

The MagMAX™ Pathogen RNA/DNA Kit is Easy to Automate Purify RNA/DNA from 96 samples in approximately 45 minutes (Fig. 2) using the MagMAX™ Express-96 Deep Well Magnetic Particle Processor. Low and high sample input volumes can be used for most sample types, and multiple sample types can be processed at the same time on the same plate after sample-specific pre-processing, saving time and plastics.

კატალოგის ნომერი: A32841

Oncomine™ BRCA კველვითი ნაკრები მოიცავს AmpliSeq™ პრაიმერთა ოლიგონუკლეოტიდების 2 ნაკრებს და საჭირო რეაგენტებს, რომლებიც Ion Torrent™ ახალი თაობის სექვენირების პლატფორმებზე ამპლიკონთა ბიბლიოთეკების გენერირებისთვის გამოიყენება. ნაკრები შექმნილია ნიმუშების სენსიტიური და სრულყოფილი ამპლიფიკაციისთვის. ანალიზი მოიცავს ადმიანის BRCA1 და BRCA2 გენების ყველა მაკოდირებელ მონაკვეთს. ექსპერიმენტის აღნიშნული ვერსია გათვლილია NGS ბიბლიოთეკის ავტომატური მომზადებისთვის, Ion Chef™ სისტემის გამოყენებით. ბიბლიოთეკის მანუალური მომზადებისთვის იხილეთ ნაკრები კატალოგის ნომრით: A32840. ნაკრების მახასიათებლები:

• ვალიდირებულია Ion 318 და Ion 530 ჩიპებთან კომპლექტში გამოყენებისთვის;
• შესაძლებლობები: SNVs, InDels და დიდი ზომის ექსონების/გენთა დელეციების/დუპლიკაციების დეტექცია;
• თავსებადია დნმ-ის ისეთ მცირე მოცულობებზე მუშაობისას, როგორიცაა ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან ან სისხლის ნიმუშებიდან გამოყოფილი 10 ნგ დნმ;
• სრულყოფილი დაფარვა მაკოდირებელი მონაკვეთების - ექსონების და სპლაისინგის საიტების დეტექციის მხრივ, ეფექტური სექვენირებისა და აკურატული ანალიზისთვის;
• პრაიმერების ოპტიმიზებული დიზაინი და ამპლიფიკაციის რეაგენტები, რომლებიც სამიზნის მაღალსპეციფიური ექსტრაქციის საშუალებას ქმნის;
• 5%-იანი და უფრო მცირე მასშტაბის სომატური ვარიანტების  ვალიდირებული დეტექცია;
• მარტივი და სწრაფი პროტოკოლის მეშვეობით ბიბლიოთეკა მზადაა 3.5 საათში.

BRCA1 და BRCA2 გენები სიმსივნის სუპრესორი გენებია, რომლებიც კოდირებს დნმ-ის ჰომოლოგიურ რეპარაციაში მონაწილე ცილებს. BRCA გენის მუტაციები შედეგად იძლევა შესაბამისი ცილის სინთეზის ნაკლბობას და დაკავშირებულია სიმსივნის გენეტიკურ წინასწარგანწყობასთან. BRCA გენის მაკოდირებელ მონაკვეთში არსებული ხარვეზები იდენტიფიცირებულია როგორც სომატურ, ასევე სასქესო ხაზის უჯრედების გენომში და ასევე გვხვდება სიმსივნურ ნიმუშებში.

კატალოგის ნომერი: 4475346 Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან ("hot spot" მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™  სიმსივნური "Hotspot"-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:

• თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
• მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
• პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
• გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.

სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური "Hotspot"-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში. ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0 ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.