| ბიბლიოთეკის ტიპი: | სამიზნე მონაკვეთების ბიბლიოთეკის მომზადება |
|---|---|
| ეტაპი: | ბიბლიოთეკის მომზადება |
| საწყისი მასალა: | დნმ |
| სექვენირების ტიპი: | გენომი/დნმ |
| პროდუქტის ხაზი: | Oncomine™ |
| პროდუქტის ზომა: | 32 რეაქცია |
| ტრანსპორტირების პირობები: | მშრალი ყინული |
Oncomine™ BRCA საკვლევი ნაკრები, ბიბლიოთეკის მომზადება Ion-Chef სისტემით
კატალოგის ნომერი: A32841
Oncomine™ BRCA კველვითი ნაკრები მოიცავს AmpliSeq™ პრაიმერთა ოლიგონუკლეოტიდების 2 ნაკრებს და საჭირო რეაგენტებს, რომლებიც Ion Torrent™ ახალი თაობის სექვენირების პლატფორმებზე ამპლიკონთა ბიბლიოთეკების გენერირებისთვის გამოიყენება. ნაკრები შექმნილია ნიმუშების სენსიტიური და სრულყოფილი ამპლიფიკაციისთვის. ანალიზი მოიცავს ადმიანის BRCA1 და BRCA2 გენების ყველა მაკოდირებელ მონაკვეთს. ექსპერიმენტის აღნიშნული ვერსია გათვლილია NGS ბიბლიოთეკის ავტომატური მომზადებისთვის, Ion Chef™ სისტემის გამოყენებით. ბიბლიოთეკის მანუალური მომზადებისთვის იხილეთ ნაკრები კატალოგის ნომრით: A32840.
ნაკრების მახასიათებლები:
- ვალიდირებულია Ion 318 და Ion 530 ჩიპებთან კომპლექტში გამოყენებისთვის;
- შესაძლებლობები: SNVs, InDels და დიდი ზომის ექსონების/გენთა დელეციების/დუპლიკაციების დეტექცია;
- თავსებადია დნმ-ის ისეთ მცირე მოცულობებზე მუშაობისას, როგორიცაა ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან ან სისხლის ნიმუშებიდან გამოყოფილი 10 ნგ დნმ;
- სრულყოფილი დაფარვა მაკოდირებელი მონაკვეთების – ექსონების და სპლაისინგის საიტების დეტექციის მხრივ, ეფექტური სექვენირებისა და აკურატული ანალიზისთვის;
- პრაიმერების ოპტიმიზებული დიზაინი და ამპლიფიკაციის რეაგენტები, რომლებიც სამიზნის მაღალსპეციფიური ექსტრაქციის საშუალებას ქმნის;
- 5%-იანი და უფრო მცირე მასშტაბის სომატური ვარიანტების ვალიდირებული დეტექცია;
- მარტივი და სწრაფი პროტოკოლის მეშვეობით ბიბლიოთეკა მზადაა 3.5 საათში.
BRCA1 და BRCA2 გენები სიმსივნის სუპრესორი გენებია, რომლებიც კოდირებს დნმ-ის ჰომოლოგიურ რეპარაციაში მონაწილე ცილებს. BRCA გენის მუტაციები შედეგად იძლევა შესაბამისი ცილის სინთეზის ნაკლბობას და დაკავშირებულია სიმსივნის გენეტიკურ წინასწარგანწყობასთან. BRCA გენის მაკოდირებელ მონაკვეთში არსებული ხარვეზები იდენტიფიცირებულია როგორც სომატურ, ასევე სასქესო ხაზის უჯრედების გენომში და ასევე გვხვდება სიმსივნურ ნიმუშებში.
აღწერა
მიმოხილვა (0)
მსგავსი პროდუქტები
cDNA სინთეზის ნაკრები – SuperScript™ VILO™
კატალოგის ნომერი: 11754050
SuperScript VILO - cDNA სინთეზის კიტი შექმნილია cDNA - ს (კოპი დნმ) პირველი ჯაჭვის სინთეზისთვის ორ ეტაპიანი პჯრ რეაქციისას რეალურ დროში. კიტი 2-ტუბის ფორმატით მოიცავს VILO-სარეაქციო მიქსს და ფერმენტებს, რომლებიც ცალკე ტუბშია მოთავსებული. ფერმენტების მიქსი შეიცავს SuperScript III-რევერსპტრანსკრიპტაზას (RT), გენეტიკური ინჟინერიით მიღებულ MMLV RT-ს, რომელსაც არ გააჩნია RNase H აქტივობა და ახასიათებს გაუმჯობესებული თერმოსტაბილურობა, რაც cDNA-ს სინთეზის მაღალ ეფექტურობას განაპირობებს. კიტი შესაძლოა გამოყენებულ იქნას cDNA-ს სინთეზისთვის საწყისი რნმ-ის ფართო სპექტრის მოცულობებზე სამუშაოდ.
MagMAX™ დნმ-ის ექსტრაქციის ნაკრები
კატალოგის ნომერი: A25597
MagMAX™ DNA - სხვადასხვა ტიპის ნიმუშდან დნმ-ის გამოყოფისთვის ოპტიმიზებული ტექნოლოგიით. ნაკრებით ხორციელდება გენომური დნმ-ის (gDNA) ექსტრაქცია ისეთი ტიპის ნიმუშებიდან, როგორიცაა სისხლი, ეპითელური უჯრედები, ნერწყვი, შარდი, სისხლის ნიმუშის ფირფიტები, პირის ღრუს სითხეები და ქსოვილები. მაგნიტურ ბიდებზე დაფუძნებული ექსტრაქციის სისტემა შესაძლებელს ხდის დღის განმავლობაში გაკეთდეს ნუკლეინის მჟავების ექსტრაქცია 12-დან 500-მდე ნიმუშიდან. ექსტრაქციის ნაკრები იდეალურია ფარმაკოგენომიკური კვლევებისთვის (PGx).
MagMAX™ DNA Multi-Sample Ultra - ნაკრები ხასიათდება:
- მარტივი პროტოკოლი დნმ-ის ექსტრაქციისთვის სხვადასხვა ტიპის ბიოლოგიური ნიმუშებიდან;
- ოპტიმიზებული დნმ-ის მაღალი წარმადობით ექსტრაქციისთვის, თავსებადი OpenArray® და Ion AmpliSeq™ აპლიკაციებთან;
MagMAX™-96 ვირუსული რნმ-ის საექსტრაქციო ნაკრები
Catalog number: AM1836
The MagMAX-96 Viral RNA Isolation Kit is for the isolation of viral RNA and DNA from diverse sample types (e.g., environmental samples and biofluids). Nucleic acids purified using this kit are ideal for PCR and RT-PCR applications. For a NVSL-validated version of this kit, please see the MagMAX-96 AI⁄ND Viral RNA Isolation Kit. Benefits of MagMAX magnetic bead-based purification: Magnetic beads offer many benefits compared to other technologies for isolating RNA. Beads bind RNA more efficiently than glass fiber filters, resulting in higher and more consistent RNA yields. Additionally, because filters are not used, there is no risk of filter clogging due to cellular particulates in samples. Since only a small volume of magnetic beads is needed for high-efficiency binding, the bound RNA can be eluted in just 20–50 µL of nuclease-free water, concentrating RNA from large, dilute samples. Optimized for isolation of virus from biofluids The MagMAX Viral RNA Isolation Kit has been optimized for use with biological fluids and cell-free samples such as serum, plasma, swabs, and cell culture media. These samples often present unique challenges when purifying RNA, including low viral titers, large volumes to be processed, and sample complexity. Without the need for organic solvents or RNA precipitation, the MagMAX Viral RNA Isolation Kit eliminates the problems often encountered with other RNA isolation methods such filter clogging, large elution volumes, and inconsistent yields. With this kit, DNA and RNA input levels ranging from 20 copies to 25 x 106 copies have been quantitatively recovered from plasma, serum, and milk. And even with less sample input, pathogen detection was as sensitive (equivalent CTs) or more sensitive (lower CTs) using nucleic acid isolated with the MagMAX kit when compared to nucleic acid isolated using another company's product.
Qubit™ რნმ – HS ნაკრები
Catalog number: Q32855
The Qubit RNA HS Assay Kit, when used with the Qubit Fluorometer, provides an accurate and selective method for the quantitation of low-abundance RNA samples. The assay is highly selective for RNA and will not quantitate DNA, protein, or free nucleotides. Common contaminants, such as salts, free nucleotides, solvents, detergents, or protein, are well-tolerated in the assay. The assay kit is designed to be accurate for RNA sample concentrations between 250 pg/µL and 100 ng/µL. The kit provides concentrated assay reagent, dilution buffer, and pre-diluted RNA standards. Simply dilute the reagent using the buffer provided, add your sample (any volume between 1 µL and 20 µL is acceptable), and read the concentration using the Qubit Fluorometer.
Which product to choose for RNA HS (High Sensitivity) quantitation?
- For 1–20 samples: use this Qubit RNA HS Assay Kit with the Qubit Fluorometer
- For 20–2000 samples: use the Quant-iT RNA HS Assay Kit with microplate reader
კომპლექსური ანალიზის ნაკრები Oncomine™ v3C
კატალოგის ნომერი: A35806
Oncomine-ის ნაკრები v3 სრულყოფილი ანალიზისთვის, არის შემდეგი თაობის სექვენირების რეაგენტთა ნაკრები, რომელიც ახდენს SNV, CNV, გენთა შერწყმის, ინსერცია-დელეციების დეტექციას 161 უნიკალური გენიდან, რაც მეცნიერებს ეხმარება განახორციელონ პრეპარატების შესწავლა და სხვა კლინიკური კვლევითი პროგრამები. რეაგენტების ნაკრებში ბიბლიოთეკის მოსამზადებლად, გაერთიანიებულია პრაიმერების 4 კომპლექტი, დნმ-ის და რნმ-ის მატრიცების მულტიპლექსირებისთვის. მათი საშუალებით სექვენირების ბიბლიოთეკის მომზადება ხორციელდება ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) სიმსივნური ქსოვილებიდან. ნაკრები ოპტიმიზებულია სექვენირებისთვის Ion S5 სისტემაზე, Ion 540 ჩიპის გამოყენებით, ამრიგად ერთ რეაქციაში ხდება 8 ნიმუშის (7 ნიმუშის და ერთი ნეგატივ-კონტოლის) სექვენირება. ონკომაინის მონაცემთა ბაზის კომპიუტერულ პროგრამასთან დაკავშირებისას, მკვლევარს საშუალება ეძლევა შექმნას რეპორტი, რომელშიც მოინიშნება შესაბამისი ბმულები, მითითებები საერთაშორისოდ აღიარებული გაიდლაინებიდან და უკვე არსებული კვლევებიდან.
ნაკრების ძირითადი მახასიათებლებია:
- 161 გენის ვარიანტების ანალიზი;
- დეტექცია: SNV, CNV, ქიმერული გენები, ინსერცია-დელეციები;
- უნაკლო შესრულება ნიმუშის ისეთი მცირე მოცულობიდან, როგორიცაა 40 ng ტოტალური ნუკლეინის მჟავები (დნმ/რნმ), რომლის გამოყოფა ხდება როგორც FFPE ნიმუშებიდან, ასევე წვრილი ნემსით ჩატარებული ბიოფსიის მასალიდან;
- შედეგების კონტროლი მოლეკულური სტანდარტების და კონტროლის საფუძველზე.
მიმოხილვა
მიმოხილვები ჯერ არ არის.