Qubit™ – ტუბები

კატალოგის ნომერი: A31136 Ion AmpliSeq™ Direct FFPE - დნმ ნაკრებით შესაძლებელია დნმ-ნიმუშების მომზადება ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან. აღნიშნული ნიმუშები გამოიყენება ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის Ion AmpliSeq პროტოკოლის გამოყენებით. აღსანიშნავია, რომ დნმ-ის მისაღებად ქსოვილური ნიმუშების დეპარაფინიზაცია ამ შემთხვევაში საჭირო არ არის. კიტი თავსებადია FFPE ნიმუშებთან, რომელთა დაჭრა ხდება 10 µm სისქის ანათლებად. Ion AmpliSeq Direct FFPE -დნმ ნაკრების მახასიათებლებს შორის აღსანიშნავია:

• მარტივი პროტოკოლი, რომელიც ნიმუშის დაკარგვის პრობლემას გამორიცხავს;
• ეფექტური 30-წუთიანი პროტოკოლი, მხოლოდ 10 წუთის ხანგრძლივობის ხელით სამუშაო დროით;
• იდეალურია FFPE დნმ-ნიმუშებდან დნმ-ის გამოსაყოფად, როდესაც ნიმუში ლიმიტირებული რაოდენობითაა;
• FFPE ანათლების დეპარაფინიზაცია არ არის საჭირო;
• სპინ- ან ბიდ-დამოკიდებული დნმ-ის ექსტრაქცია არ არის საჭირო;
• Ion AmpliSeq ბიბლიოთეკის მომზადება ხდება მხოლოდ 1 ng დნმ-ნიმუშიდან;
• პროტოკოლი მოიცავს ნიმუშების ურაცილ-D-გლიკოზილაზათი დამუშავებას, რაც დეამინირებული ციტოზინის არიდან ელიმინაციის შესაძლებლობას ქმნის.

Catalog number:  AM1835 Applied Biosystems® This kit is for the isolation of viral RNA and DNA from diverse sample types (i.e., environmental samples and biofluids). Nucleic acids purified using this kit are ideal for PCR and RT-PCR applications. This is a first generation MagMAX™ Viral RNA Isolation Kit validated by the NVSL for use with AI/ND viruses. Perfect for working with low viral concentrations, the kit contains sufficient reagents for 4 x 96 reactions.

• Validated by the NVSL for use with AI/ND viruses
• Recover as few as 10 copies of viral RNA from 100–400 µL sample
• Typical viral RNA recovery of >50%
• Ideal when working with low viral concentrations
• Linear recovery down to 50 transcripts
• 96 samples can be processed in 30 minutes
• Easily integrated into robotic platforms

Benefits of MagMAX™ Magnetic Bead-Based Purification: Magnetic beads offer many benefits compared to other technologies for isolating RNA. Beads bind RNA more efficiently than glass fiber filters, resulting in higher and more consistent RNA yields. Additionally, because filters are not used, there is no risk of filter clogging due to cellular particulates in samples. Since only a small volume of magnetic beads is needed for high-efficiency binding, the bound RNA can be eluted in just 20–50 µL of nuclease-free water, concentrating RNA from large, dilute samples. Optimized for Isolation of Virus from Biofluids: The Applied Biosystems® MagMAX™ Viral RNA Isolation Kit has been optimized for use with biological fluids and cell-free samples such as serum, plasma, swabs, and cell culture media. These samples often present unique challenges when purifying RNA, including low viral titers, large volumes to be processed, and sample complexity. Without the need for organic solvents or RNA precipitation, the MagMAX™ Viral RNA isolation kit eliminates the problems often encountered with other RNA isolation methods such filter clogging, large elution volumes, and inconsistent yields.

Catalog number:  Q32855 The Qubit RNA HS Assay Kit, when used with the Qubit Fluorometer, provides an accurate and selective method for the quantitation of low-abundance RNA samples. The assay is highly selective for RNA and will not quantitate DNA, protein, or free nucleotides. Common contaminants, such as salts, free nucleotides, solvents, detergents, or protein, are well-tolerated in the assay. The assay kit is designed to be accurate for RNA sample concentrations between 250 pg/µL and 100 ng/µL. The kit provides concentrated assay reagent, dilution buffer, and pre-diluted RNA standards. Simply dilute the reagent using the buffer provided, add your sample (any volume between 1 µL and 20 µL is acceptable), and read the concentration using the Qubit Fluorometer. Which product to choose for RNA HS (High Sensitivity) quantitation?

• For 1–20 samples: use this Qubit RNA HS Assay Kit with the Qubit Fluorometer
• For 20–2000 samples: use the Quant-iT RNA HS Assay Kit with microplate reader

კატალოგის ნომერი: 4475346 Ion AmpliSeq™ სიმსივნური მარკერების (Hotspot) პანელი v2 წარმოადგენს პრაიმერების ერთ კომპლექტს, რომელიც გამოიყენება მულტიპლექსური პჯრ რეაქციის შესასრულებლად, რომლის მიმდინარეობისას მზადდება ამპლიკონების ბიბლიოთეკა გენომის სპეციფიკური მონაკვეთებიდან ("hot spot" მონაკვეთები), რომლებიც ხშირად განიცდის მუტაციას და განაპირობებს სიმსივნური პროცესების ინდუცირებას (გადმოიწერეთ Ion AmpliSeq™  სიმსივნური "Hotspot"-ების პანელი v2). Ion AmpliSeq™ გამოყენებისთვის მზა სიმსივნური მუტაციების პანელი გვთავაზობს:

• თავსებადობა FFPE ნიმუშებთან;
• მაქსიმალურად სრული დაფარვა გაცილებით მაღალ-ეფექტური სექვენირებისთვის, მინიმალური დანახარჯების ფონზე;
• პრაიმერების გაუმჯობესებული დიზაინი მეტი სანდოობისთვის;
• გენომური ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია Torrent Suite v3.0 და Variant Caller Plugin კომპიუტერული პროგრმებით.

სიმარტივე, სიჩქარე და მასშტაბურობა ერთ Ion AmpliSeq™ ტექნოლოგიაში Ion AmpliSeq™ ტენოლოგიის სიმარტივის შენარჩუნებასთან ერთად, Ion AmpliSeq™ სიმსივნური "Hotspot"-ების დეტექციის v2 პანელი სიმსივნეების გენეტიკის შესწავლის შესაძლებლობას ქმნის FFPE ქსოვილებიდან მიღებული დნმ-ის ნიმუშების ისეთი მცირე მოცულობებისას, როგორიცაა სამიზნე ბიბლიოთეკის კონსტრუქციისთვის საჭირო 10 ng დნმ. აღნიშნული პანელი სამიზნე ბიბლიოთეკის მომზადებას შესაძლებელს ხდის დაახლოებით 3.5 საათში. ვარიანტების გაუმჯობესებული დეტექცია კომპიუტერული პროგრამით -Torrent Suite v3.0 ინტუიტიური Torrent Suite და Variant Caller Plugin პროგრამები შესაძლებელს ქმნის გენეტიკური ვერიანტების იდენტიფიცირება ექსტრაქგირებული დნმ-დან განხორციელდეს მხოლოდ 10 საათში. პროგრამა გაუმჯობესებული ალგორითმებით უფრო სენსიტიურად ახდენს ინსერცია-დელეციების, SNP დეტექციას. Ion Reporter™ პროგრამით შესაძლებელია აღმოჩენილი გენეტიკური ვარიანტების ანოტირება რუტინული დნმ-ანალიზებისთვის, რაც აუმჯობესებს კლიკურ კვლევებს.