ჩიპის ნაკრები Ion 520™

კატალოგის ნომერი: A34019 Ion 510 & Ion 520 & Ion 530 Chef-ნაკრები (1 სექვენირების რეაქცია თითოეული ინიციალიზაციისას) საშუალებას იძლევა ნიმუშის მომზადება განხორციელდეს ავტომატურად. Ion Chef სისტემით მომზადებული რიდების სიგრძე აღნიშნული ნაკრების შემთხვევაში შეადგენს 400 აზოტოვან ფუძეს, რომელთა სექვენირება ხორციელდება Ion S5 ან Ion S5 XL სექვენირების პლატფორმების საშუალებით. Ion 510/Ion 520/Ion 530 ნაკრები მოიცავს ერთჯერადი გამოყენებისთვის წიანასწარ მომზადებულ სექვენირების რეაქგენტების კარტრიჯს, რომელსაც ინტეგრირებული აქვს ნიმუშის კონტროლის, მიწოდების და ავტომატური პროტოკოლის მართვის ფუნქციები. ნაკრებით შესაძლებელია ჩიპებზე დატანილი 8 ნიმუშის სექვენირება. რეაქციის ყოველი ინიციალიზაციისას შესაძლებელია 1 სექვენირების რეაქციის ჩატარება. სექვენირების 2 რეაქციის გასაშვებად თითოეული ინიციალიზაციისას (200 აზოტოვანი ფუძე) იხილეთ ნაკრები: No. A34461. Ion 510 / Ion 520 / Ion 530 Chef - ნაკრები:

• ნიმუშის მომზადება და ჩიპში ჩატვირთვა 400 აზოტოვან ფუძემდე სიგძის მქონე რიდებისთვის;
• სექვენირება გამარტივებულია ერთჯერადი, გამოყენებისთვის მზა ფორმის რეაგენტების კარტრიჯებით;
• სწრაფი და მარტივი სექვენირება, 15 წუთზე ნაკლები დრო ხელით სამუშაოდ;
• მაქსიმალური მოქნილობა ჩიპებთან თავსებადობის მხრივ: Ion 510, Ion 520, და Ion 530 ჩიპები.

კატალოგის ნომერი: A27766 Ion 540 ჩიპის ნაკრები მოიცავს 8 ბარკოდირებულ ჩიპს, რომლებიც გამიოყენება Ion S5 და Ion S5 XL სექვენირების სისტემებთან კომპლექტში. Ion 540 ჩიპის გამოყენებით ელექტრონულად ხდება თითოეული ნუკლეოტიდის ჩართვის დეტექცია პოლიმერიზაციისას, ფლუორესცენტული სიგნალის გარეშე. ოპტიკაზე ორიენტირებული დეტექციის სისტემის თავიდან აცილება შემდეგი თაობის სექვენირების ტექნოლოგიას ანიჭებს სისწრაფეს და ამცირებს მის ფასს. ამ შემთხვევაში, 200 bp სიგრძის ნუკლეოტიდური თანმიმდევრობის სექვენირების დრო 2.5 საათზე ნაკლებია. Ion 540 ჩიპის ნაკრების მახასიათებლები:

• ნიმუშის კონტროლის ფუნქცია ინტეგრირებული ბარკოდის მეშვეობით;
• რეაქციის სისწრაფე: მხოლოდ 2.5 - 4 საათში 60-80 მლნ რიდის გენერირება, სიგრძით 200 აზოტოვანი ფუძე;
• მრავალი სხვადასხვა ტიპის ექსპერიმენტის შესრულების შესაძლებლობა, მათ შორის ადამიანის ექსომების (მაქს. 3) სექვენირება, ტრანსკრიპტომების პროფილირება და გენეტიკური პანელების სამიზნე რესექვენირება;
• თავსებადობა ბიბლიოთეკის მომზადების თანამედროვე მეთოდებთან.

შენიშვნები: აღნიშნული ნაკრები თავსებადია მხოლოდ Ion S5 და Ion S5 XL სისტემებთან. ნაკრები თავსებადია მხოლოდ Ion 540 Chef-ნაკრებთან და IIon 540 OT2 ნაკრებთან.

კატალოგის ნომერი: A32841

Oncomine™ BRCA კველვითი ნაკრები მოიცავს AmpliSeq™ პრაიმერთა ოლიგონუკლეოტიდების 2 ნაკრებს და საჭირო რეაგენტებს, რომლებიც Ion Torrent™ ახალი თაობის სექვენირების პლატფორმებზე ამპლიკონთა ბიბლიოთეკების გენერირებისთვის გამოიყენება. ნაკრები შექმნილია ნიმუშების სენსიტიური და სრულყოფილი ამპლიფიკაციისთვის. ანალიზი მოიცავს ადმიანის BRCA1 და BRCA2 გენების ყველა მაკოდირებელ მონაკვეთს. ექსპერიმენტის აღნიშნული ვერსია გათვლილია NGS ბიბლიოთეკის ავტომატური მომზადებისთვის, Ion Chef™ სისტემის გამოყენებით. ბიბლიოთეკის მანუალური მომზადებისთვის იხილეთ ნაკრები კატალოგის ნომრით: A32840. ნაკრების მახასიათებლები:

• ვალიდირებულია Ion 318 და Ion 530 ჩიპებთან კომპლექტში გამოყენებისთვის;
• შესაძლებლობები: SNVs, InDels და დიდი ზომის ექსონების/გენთა დელეციების/დუპლიკაციების დეტექცია;
• თავსებადია დნმ-ის ისეთ მცირე მოცულობებზე მუშაობისას, როგორიცაა ფორმალინით ფიქსირებული, პარაფინიზირებული (FFPE) ქსოვილებიდან ან სისხლის ნიმუშებიდან გამოყოფილი 10 ნგ დნმ;
• სრულყოფილი დაფარვა მაკოდირებელი მონაკვეთების - ექსონების და სპლაისინგის საიტების დეტექციის მხრივ, ეფექტური სექვენირებისა და აკურატული ანალიზისთვის;
• პრაიმერების ოპტიმიზებული დიზაინი და ამპლიფიკაციის რეაგენტები, რომლებიც სამიზნის მაღალსპეციფიური ექსტრაქციის საშუალებას ქმნის;
• 5%-იანი და უფრო მცირე მასშტაბის სომატური ვარიანტების  ვალიდირებული დეტექცია;
• მარტივი და სწრაფი პროტოკოლის მეშვეობით ბიბლიოთეკა მზადაა 3.5 საათში.

BRCA1 და BRCA2 გენები სიმსივნის სუპრესორი გენებია, რომლებიც კოდირებს დნმ-ის ჰომოლოგიურ რეპარაციაში მონაწილე ცილებს. BRCA გენის მუტაციები შედეგად იძლევა შესაბამისი ცილის სინთეზის ნაკლბობას და დაკავშირებულია სიმსივნის გენეტიკურ წინასწარგანწყობასთან. BRCA გენის მაკოდირებელ მონაკვეთში არსებული ხარვეზები იდენტიფიცირებულია როგორც სომატურ, ასევე სასქესო ხაზის უჯრედების გენომში და ასევე გვხვდება სიმსივნურ ნიმუშებში.

Catalog number:  Q32855 The Qubit RNA HS Assay Kit, when used with the Qubit Fluorometer, provides an accurate and selective method for the quantitation of low-abundance RNA samples. The assay is highly selective for RNA and will not quantitate DNA, protein, or free nucleotides. Common contaminants, such as salts, free nucleotides, solvents, detergents, or protein, are well-tolerated in the assay. The assay kit is designed to be accurate for RNA sample concentrations between 250 pg/µL and 100 ng/µL. The kit provides concentrated assay reagent, dilution buffer, and pre-diluted RNA standards. Simply dilute the reagent using the buffer provided, add your sample (any volume between 1 µL and 20 µL is acceptable), and read the concentration using the Qubit Fluorometer. Which product to choose for RNA HS (High Sensitivity) quantitation?

• For 1–20 samples: use this Qubit RNA HS Assay Kit with the Qubit Fluorometer
• For 20–2000 samples: use the Quant-iT RNA HS Assay Kit with microplate reader